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姓 名: 牛登科                  英文版主页：English Version
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个人自述

生于河北农村，长于河北农村。成年后在河北大学、兰州大学、武汉大学、中国科学院水生生物研究所、法国Universite Paul Sabatier, Toulouse III、北京师范大学等单位攻读学位、做博士后研究或工作。自从上研究生以来，学习过生物学的多个分支学科（但都没学好，目前在分子进化领域混口饭）、想到过一些稀奇古怪的idea（都很难检验）、获得过一些不值得提起的奖励（奖金对生活帮助还是很大的）、发表过一些几乎没人引用的论文（升学、就业、评职等还是有用的）、有了几年自我感觉良好的教学经历（不知道学生们评价如何），指导了几名研究生（但愿没有误人子弟）。现虽近不惑之年，轻狂之心犹在，甚好西方之达士之铭言，"识人所共识，思人所未思"。

研究方向

· 分子进化与比较基因组学、 （与林魁等老师共同的）计算生物学。欢迎有志于以上研究方向的同学报考我们的研究生，招生对象不限于生物学背景，农业、林业、医学、计算机（或信息科学）、数学和物理学背景的同学我们也非常欢迎。考试科目见北京师范大学硕士生招生简章。

本方向已毕业的5位硕士研究生均找到了理想的工作或到国外理想的学校攻读博士学位，详细情况见研究生培养一栏。

本方向(分子进化与比较基因组学)将从2008年开始在生态学专业中招收攻读博士学位研究生（生物信息学专业尚无博士点，目前仅有硕士点）。 考试科目见北京师范大学博士生招生简章。

研究兴趣

· 对所有生命现象都感兴趣。限于个人精力和能力，目前主要研究内含子的起源与进化，包括内含子存在的代价和带来的好处、进化历史上基因丢失和获得内含子的机理等。

治学理念和研究工作基本程序

·    识人所共识，思人所未思。 "Discovery consists of seeing what everybody has seen and thinking what nobody has thought" (by Albert von Szent-Gyorgyi).

·    根据已有生物学知识，预测差异或相关性，用生物信息学手段检验差异或相关性是否存在。

·    有些本实验室无法检验的想法以假说的形式发表。

科研项目

• 教育部“新世纪优秀人才支持计划”，50万元，2008年1月至2010年12月。

• 国家自然科学基金项目，多细胞生物起源及其与癌发生的比较研究，18万元，2003年1月至2005年12月。

教学

·         “生命科学概论”全校本科生公共选修课

·         “基因组学”生命科学学院研究生课程

研究生培养

·    2003年入学：侯文茹

·    2004年入学：李姝玮、王海芳、冯靓、常姗姗

·    2005年入学：刘晓、李宁

·    2006年入学：黄一飞、吕杰、张冰君、张蕾颖

·    2007年入学：李宁（博士研究生）、郭文萍、刘金华

·    2008年入学：张蕾颖（博士研究生）、曹建立、杨宇飞

"The ultimate goal of scholarly scientific publishing (is) to advance our understanding of the natural world." (Alberts B et al. Reviewing peer review. Science 321: 15, 2008)

论文(注：论文版权分别属于不同出版社或作者，限非营利性个人使用).

1. Niu DK (2008). Exon definition as a potential negative force against intron losses in evolution. Biology Direct 3: 46 doi:10.1186/1745-6150-3-46.[2007IF=3.3] [Free Full Text][全文]

2. Huang YF and Niu DK (2008). Evidence against the energetic cost hypothesis for the short introns in highly expressed genes. BMC Evolutionary Biology 8: 154. [2007IF=4.1] [Free Full Text][全文]

3. Lv J, Li N and Niu DK (2008). Association between the availability of environmental resources and the atomic composition of organismal proteomes: Evidence from Prochlorococcus strains living at different depths. Biochemical and Biophysical Research Communications 375: 241-246. [2007IF=2.7][全文]

4. Wang HF, Hou WR and Niu DK (2008). Strand compositional asymmetries in vertebrate large genes. Molecular Biology Reports 35: 163-169. [2007IF=0.83] [全文]

5. Li SW, Feng L and Niu DK (2007). Selection for the miniaturization of highly expressed genes. Biochemical and Biophysical Research Communications 360: 586-592. [全文] 我们在这篇文章上倾注了大量心血，对研究结果也很满意。但此文投稿过程颇为曲折，历经多种期刊、无数次修改，见识了形形色色的审稿意见，当然从中我们也学到了很多。

6. Niu DK (2007). Protecting exons from deleterious R-loops: a potential advantage of having introns. Biology Direct 2: 11. [全文] [Free Full Text]

7. Feng L and Niu DK (2007). Relationship between mRNA stability and length: An old question with a new twist. Biochemical Genetics 45: 131-137. [2007IF=0.86] [全文]

8. Wang HF, Feng L and Niu DK (2007). Relationship between mRNA stability and intron presence. Biochemical and Biophysical Research Communications 354: 203-208. [全文]. 很高兴，最近J. Biol. Chem.上发表的一篇实验论文证实了我们计算的结果，“The half-life of KC mRNA was markedly prolonged when the primary transcript was obtained from a genomic clone containing three introns as compared with the half-life observed with sequence-identical KC mRNA derived from an intron-free cDNA construct….“

9. Hou WR, Wang HF and Niu DK (2006). Replication-associated strand asymmetries in vertebrate genomes and implications for replicon size, DNA replication origin and termination. Biochemical and Biophysical Research Communications 344: 1258-1262. [全文]

10. Niu DK (2005). Low-level illegitimate transcription of genes may be to silence the genes. Biochemical and Biophysical Research Communications 337: 413-414. [全文]

11. Niu DK, Hou WR and Li SW (2005). mRNA-mediated intron losses: Evidence from extraordinarily large exons. Molecular Biology and Evolution 22: 1475-1481. [2007IF=6.4] [全文] [Free Full Text]

12. Song L, Niu DK, Lei L, Ou D, Gevrey M, Liu Y, Hou G and Lek S (2004). Predictive model of algal blooms in Dianchi Lake using artificial neural networks. The Japanese Journal of Phycology 52: S41-S47.

13. Niu DK, Lin K and Zhang DY (2003). Strand compositional asymmetries of nuclear DNA in eukaryotes. Journal of Molecular Evolution 57: 325-334. [2007IF=3.2] [全文]

14. Niu DK, Chen JK and Liu YD (2001). Margulis' theory on division of labor in cells revisited. Acta Biotheoretica 49: 23-28. [2007IF=0.88] [全文]

15. Niu DK and Chen JK (1998/1999). Origin of cancerous cells from tumour. Acta Biotheoretica 46: 379-381. [全文]

16. Niu DK and Chen JK (1997). Evolutionary advantages of cell specialization: Save and protect DNA. Journal of Theoretical Biology 187: 39-43. [2007IF=2.3] [全文]

17. Niu DK, Wang MG and Wang YF (1997). Plant cellular osmotica. Acta Biotheoretica 45: 161-169. [全文]

18. Niu DK and Wang YF (1995). Why animals have tumours. Acta Biotheoretica 43: 279-280. [全文] 第一作者现在自己认为此文中关于肿瘤的假说正确的可能性微乎其微，请读者慎重引用。

19. 倪建福，周文麟，牛登科等. (1995). 长穗偃麦草DNA导入小麦后代变异系醇溶蛋白的研究。西北植物学报 15(5): 21-24。

20. 王鸣刚，牛登科等. (1995). 小麦耐盐变异体的筛选。II. 小麦耐盐细胞系的筛选及生理生化特性的分析。西北植物学报 15(5): 15-20。

21. 高清祥，王鸣刚，牛登科等. (1995). 离体筛选小麦变异系的研究。西北植物学报 15(8): 144-152。

22. 裴新梧，倪建福，仲乃琴，牛登科. (1995). 用改良缺体回交选育小麦──黑麦异代换系。甘肃农业科技 1995(5): 3-4。

简历

·         2003年8月至今在北京师范大学生命科学学院任教，副教授 、教授。

·         2001年11月2003年8月在北京师范大学生命科学学院生态研究所做博士后研究。

·         2000年9月至2001年8月在法国国家研究部得资助下在法国国家研究中心(CNRS)-图卢兹第三大学(Universite Paul Sabatier, Toulouse III)的联合实验室CESAC做博士后合作研究。

·         1999年7月至2001年11月在中国科学院水生生物研究所进行博士后研究，2001年11月获得中国科学院副研究员任职资格。

·         1996年9月至1999年7月在武汉大学生命科学学院植物学专业学习，获理学博士学位。

·         1993年9月至1996年7月在兰州大学生物学系细胞生物学专业学习，获理学硕士学位。

·         1989年9月至1993年7月在河北大学生物学系微生物及生化专业学习， 获理学学士学位。

·         1971年生于河北农村。