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数据核验
/设置参数 / 结果展示
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请根据提示,规范上传信息,共五步:
1、请选择实验是否涉及化合物/药物信息
1.1 选择实验日期*:
化合物
点击输入
1.2 输入项目编号*:
请输入该实验所属科研项目编号。
1.3 填写实验名称*:
物药物
符合实验内容,汉字数字字母皆可。
1.4 选择是否涉及化合物/药物信息:
2、添加化合物/粗提物信息
2.1 受试物名称*
*.
如:美沙拉嗪或者Mesalazine
2.2 剂型/性状
/
如:片剂。白色粉末等
2.3 来源*
*.正正
如:xx公司。说明从哪个公司购买,或者哪个课题组合成制备
2.4 保存条件及配制方法*
如:-20°C(粉末状);-80°C(溶于溶剂);25%PEG400溶解(体内实验);DMSO溶解等(体外实验)。
点击验证
重置
2、添加化合物/粗提物信息
2.1 受试物名称*
*.
如:美沙拉嗪或者Mesalazine
2.2 化合物CAS号
如:41372-02-5。Chemical Abstracts Service (CAS) registry number
2.3 上传化合物2D/3D/晶体结构:
..........
点击上传,或者拖拽文件到此
2.4 分子式*
*.正
如:C7H7NO3。表明化合物的物质分子组成及分子量
2.5 SMILES结构式*
*.正
如:C1=CC(=C(C=C1N)C(=O)O)O。表明化合物的结构,点击
查看结构
2.6 剂型/性状
/
如:片剂。白色粉末等
2.7 化合物批号
如:2020010-20。提供化合物所属批号
2.8 来源*
*.正正
如:xx公司。说明从哪个公司购买,或者哪个课题组合成制备
2.9 纯度*
*.正正
如:99.62。%已内置。表明化合物的含量
2.10 保存条件及配制方法*
如:-20°C(粉末状);-80°C(溶于溶剂);25%PEG400溶解(体内实验);DMSO溶解等(体外实验)。
点击验证
重置
3、添加样本信息
3.1 实验模型
(1) 所属研究领域
如:抗肿瘤药理活性
(2) 模型名称*
*.正
如:A药对小鼠GL261脑瘤的生长抑制作用
3.2 实验对象
3.2.1 选择实验对象:
填写细胞信息*
*.正
如:GL261,广州吉妮欧生物科技有限公司
填写病毒信息*
*.正
如:COVID-19
填写外泌体信息*
*.正
如:脂肪间充质干细胞外泌体(Exosomes-ADMSCs)
填写其他信息*
*.正
如:xx有限公司
请输入动物信息*
正正
如:小鼠,KM,北京华阜康生物科技股份有限公司。说明品系,来源等信息
上传动物伦理申请:
点击上传,或者拖拽文件到此
上传动物合格证:
正
点击上传,或者拖拽文件到此
3.3 样品处理方法
(1) 化合物浓度/分组*
如:A药,1.5625, 3.125, 6.25, 12.5, 25.0, 50.0, 75.0 μmol/L或者A药,2.5, 5.0, 7.5, 10.0, 15.0, 20.0 mg/kg(可以用数字,也可以用科学计数法表示;单位可以是摩尔浓度,也可以是克分子浓度)
(2) 作用时间*
正/正正
如:A药:造模/接种后1-7天;A药:造模/接种细胞后72h
(3) 给药频率*
正/正正
如:如每天一次,隔天一次,每周一次等;24h后加药等
(4) 给药方式*
正/正正
如:灌胃给药、腹腔注射、尾静脉注射等;加入细胞培养上清中等
3.4 测序信息
(1) 测序方法*
正/正正
如:RNA-seq
(2) 测序平台*
正/正正
如:Illumina NextSeq1000
点击验证
重置
4、对原始数据处理主要流程的描述
4.1 点击选择常见操作
质量控制 FastQC
质量控制 Trimmomatic
测序数据比对(mapping) BWA
测序数据比对(mapping) Bowtie
测序数据比对(mapping) Tophat
4.2 点击输入上面未列出操作
对原始测序数据的主要处理
+
点击新增下一步
点击验证
重置
5、请上传表达矩阵
是否进行标准化:
示例文件
文件类型
表达矩阵
分组情况
表达矩阵示例文件1.txt
分组情况示例文件1.txt
表达矩阵示例文件2.txt
分组情况示例文件2.txt
上传表达矩阵文件:
点击上传,或者拖拽文件到此
上传分组情况文件:
点击上传,或者拖拽文件到此
点击验证
重置